Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PTPRMP28827 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
PTPRMP28827 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
PTPRMP28827 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PTPRMP28827 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
PTPRMP28827 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
PTPRMP28827 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
PTPRMP28827 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
PTPRMP28827 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
PTPRMP28827 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PTPRMP28827 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PTPRMP28827 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRMP28827 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRMP28827 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRMP28827 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRMP28827 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRMP28827 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRMP28827 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRMP28827 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRMP28827 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
PTPRMP28827 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
PTPRMP28827 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
PTPRMP28827 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
PTPRMP28827 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
PTPRMP28827 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
PTPRMP28827 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
PTPRMP28827 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PTPRMP28827 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PTPRMP28827 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
PTPRMP28827 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
PTPRMP28827 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
PTPRMP28827 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
PTPRMP28827 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
PTPRMP28827 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PTPRMP28827 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PTPRMP28827 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PTPRMP28827 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
PTPRMP28827 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PTPRMP28827 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PTPRMP28827 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PTPRMP28827 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PTPRMP28827 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PTPRMP28827 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
PTPRMP28827 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PTPRMP28827 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PTPRMP28827 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
PTPRMP28827 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
PTPRMP28827 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PTPRMP28827 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
PTPRMP28827 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PTPRMP28827 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PTPRMP28827 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PTPRMP28827 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
PTPRMP28827 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PTPRMP28827 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRMP28827 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRMP28827 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRMP28827 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRMP28827 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PTPRMP28827 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PTPRMP28827 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
PTPRMP28827 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PTPRMP28827 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PTPRMP28827 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
PTPRMP28827 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
PTPRMP28827 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PTPRMP28827 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PTPRMP28827 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PTPRMP28827 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
PTPRMP28827 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PTPRMP28827 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PTPRMP28827 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PTPRMP28827 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PTPRMP28827 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PTPRMP28827 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PTPRMP28827 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PTPRMP28827 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
PTPRMP28827 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PTPRMP28827 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PTPRMP28827 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PTPRMP28827 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PTPRMP28827 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PTPRMP28827 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PTPRMP28827 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
PTPRMP28827 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTPRMP28827 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTPRMP28827 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
PTPRMP28827 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
PTPRMP28827 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
PTPRMP28827 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
PTPRMP28827 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PTPRMP28827 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PTPRMP28827 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PTPRMP28827 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PTPRMP28827 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PTPRMP28827 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PTPRMP28827 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PTPRMP28827 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
PTPRMP28827 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
PTPRMP28827 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
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