Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMOD1P28289 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMOD1P28289 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMOD1P28289 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMOD1P28289 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMOD1P28289 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMOD1P28289 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMOD1P28289 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMOD1P28289 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMOD1P28289 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD1P28289 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD1P28289 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD1P28289 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD1P28289 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD1P28289 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMOD1P28289 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMOD1P28289 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMOD1P28289 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMOD1P28289 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMOD1P28289 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMOD1P28289 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMOD1P28289 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD1P28289 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD1P28289 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD1P28289 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD1P28289 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMOD1P28289 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMOD1P28289 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMOD1P28289 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMOD1P28289 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD1P28289 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD1P28289 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD1P28289 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD1P28289 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD1P28289 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD1P28289 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD1P28289 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD1P28289 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD1P28289 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD1P28289 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMOD1P28289 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMOD1P28289 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMOD1P28289 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD1P28289 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD1P28289 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD1P28289 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD1P28289 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMOD1P28289 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TMOD1P28289 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TMOD1P28289 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMOD1P28289 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMOD1P28289 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMOD1P28289 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TMOD1P28289 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMOD1P28289 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMOD1P28289 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMOD1P28289 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMOD1P28289 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMOD1P28289 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMOD1P28289 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMOD1P28289 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMOD1P28289 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMOD1P28289 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMOD1P28289 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD1P28289 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD1P28289 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD1P28289 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD1P28289 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD1P28289 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMOD1P28289 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMOD1P28289 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMOD1P28289 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD1P28289 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD1P28289 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD1P28289 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD1P28289 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD1P28289 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD1P28289 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMOD1P28289 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMOD1P28289 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms