Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA1P25391 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMA1P25391 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMA1P25391 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMA1P25391 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMA1P25391 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMA1P25391 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMA1P25391 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMA1P25391 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMA1P25391 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMA1P25391 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMA1P25391 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMA1P25391 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMA1P25391 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMA1P25391 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMA1P25391 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA1P25391 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA1P25391 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA1P25391 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA1P25391 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA1P25391 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA1P25391 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA1P25391 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA1P25391 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA1P25391 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA1P25391 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA1P25391 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA1P25391 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA1P25391 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA1P25391 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA1P25391 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LAMA1P25391 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMA1P25391 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMA1P25391 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMA1P25391 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA1P25391 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA1P25391 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA1P25391 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA1P25391 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA1P25391 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA1P25391 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA1P25391 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA1P25391 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA1P25391 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA1P25391 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA1P25391 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA1P25391 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA1P25391 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA1P25391 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA1P25391 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA1P25391 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA1P25391 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA1P25391 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMA1P25391 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMA1P25391 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMA1P25391 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMA1P25391 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMA1P25391 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMA1P25391 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMA1P25391 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA1P25391 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA1P25391 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA1P25391 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA1P25391 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA1P25391 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMA1P25391 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMA1P25391 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMA1P25391 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMA1P25391 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMA1P25391 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA1P25391 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA1P25391 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA1P25391 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA1P25391 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA1P25391 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA1P25391 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA1P25391 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA1P25391 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMA1P25391 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMA1P25391 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMA1P25391 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMA1P25391 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMA1P25391 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMA1P25391 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMA1P25391 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMA1P25391 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms