Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMA2P24043 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMA2P24043 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMA2P24043 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMA2P24043 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMA2P24043 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMA2P24043 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMA2P24043 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMA2P24043 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMA2P24043 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMA2P24043 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMA2P24043 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMA2P24043 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMA2P24043 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMA2P24043 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMA2P24043 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMA2P24043 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMA2P24043 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMA2P24043 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMA2P24043 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMA2P24043 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMA2P24043 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMA2P24043 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMA2P24043 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMA2P24043 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMA2P24043 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMA2P24043 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMA2P24043 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMA2P24043 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMA2P24043 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMA2P24043 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMA2P24043 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMA2P24043 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMA2P24043 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMA2P24043 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMA2P24043 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMA2P24043 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMA2P24043 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMA2P24043 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMA2P24043 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMA2P24043 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMA2P24043 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMA2P24043 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMA2P24043 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMA2P24043 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMA2P24043 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMA2P24043 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMA2P24043 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMA2P24043 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMA2P24043 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMA2P24043 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMA2P24043 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMA2P24043 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMA2P24043 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMA2P24043 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMA2P24043 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMA2P24043 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMA2P24043 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMA2P24043 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMA2P24043 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMA2P24043 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms