Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPREP23469 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPREP23469 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPREP23469 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPREP23469 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPREP23469 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPREP23469 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPREP23469 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPREP23469 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPREP23469 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPREP23469 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPREP23469 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPREP23469 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPREP23469 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPREP23469 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPREP23469 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPREP23469 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPREP23469 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPREP23469 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPREP23469 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPREP23469 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPREP23469 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPREP23469 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPREP23469 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPREP23469 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPREP23469 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPREP23469 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PTPREP23469 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPREP23469 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPREP23469 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPREP23469 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPREP23469 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPREP23469 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPREP23469 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPREP23469 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPREP23469 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPREP23469 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPREP23469 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPREP23469 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPREP23469 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPREP23469 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPREP23469 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPREP23469 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPREP23469 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPREP23469 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPREP23469 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPREP23469 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPREP23469 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPREP23469 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPREP23469 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPREP23469 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPREP23469 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPREP23469 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPREP23469 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPREP23469 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPREP23469 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPREP23469 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPREP23469 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPREP23469 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPREP23469 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPREP23469 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPREP23469 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPREP23469 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPREP23469 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPREP23469 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPREP23469 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPREP23469 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPREP23469 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPREP23469 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPREP23469 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPREP23469 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPREP23469 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPREP23469 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPREP23469 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPREP23469 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPREP23469 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPREP23469 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPREP23469 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPREP23469 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPREP23469 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPREP23469 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPREP23469 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPREP23469 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPREP23469 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPREP23469 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPREP23469 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPREP23469 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPREP23469 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPREP23469 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPREP23469 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPREP23469 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPREP23469 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPREP23469 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPREP23469 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPREP23469 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPREP23469 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPREP23469 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPREP23469 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPREP23469 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPREP23469 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms