Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRDP23468 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRDP23468 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRDP23468 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRDP23468 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRDP23468 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRDP23468 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRDP23468 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRDP23468 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRDP23468 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRDP23468 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRDP23468 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRDP23468 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRDP23468 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRDP23468 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRDP23468 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRDP23468 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRDP23468 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRDP23468 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRDP23468 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRDP23468 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRDP23468 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRDP23468 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRDP23468 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRDP23468 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRDP23468 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRDP23468 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRDP23468 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRDP23468 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRDP23468 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRDP23468 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRDP23468 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRDP23468 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRDP23468 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRDP23468 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRDP23468 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRDP23468 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRDP23468 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRDP23468 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PTPRDP23468 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRDP23468 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRDP23468 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
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