Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CA4P22748 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CA4P22748 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CA4P22748 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CA4P22748 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CA4P22748 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CA4P22748 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CA4P22748 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CA4P22748 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CA4P22748 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CA4P22748 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CA4P22748 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CA4P22748 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CA4P22748 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CA4P22748 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CA4P22748 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CA4P22748 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CA4P22748 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CA4P22748 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CA4P22748 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CA4P22748 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CA4P22748 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CA4P22748 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CA4P22748 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CA4P22748 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CA4P22748 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CA4P22748 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CA4P22748 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CA4P22748 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CA4P22748 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CA4P22748 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CA4P22748 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CA4P22748 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CA4P22748 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CA4P22748 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CA4P22748 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CA4P22748 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CA4P22748 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CA4P22748 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CA4P22748 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CA4P22748 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CA4P22748 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CA4P22748 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CA4P22748 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CA4P22748 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CA4P22748 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CA4P22748 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CA4P22748 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CA4P22748 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CA4P22748 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CA4P22748 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CA4P22748 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CA4P22748 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CA4P22748 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CA4P22748 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CA4P22748 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CA4P22748 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CA4P22748 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CA4P22748 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CA4P22748 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CA4P22748 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CA4P22748 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CA4P22748 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CA4P22748 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CA4P22748 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CA4P22748 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CA4P22748 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CA4P22748 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CA4P22748 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CA4P22748 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CA4P22748 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CA4P22748 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CA4P22748 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CA4P22748 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CA4P22748 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CA4P22748 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CA4P22748 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CA4P22748 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CA4P22748 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CA4P22748 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CA4P22748 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CA4P22748 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CA4P22748 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CA4P22748 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CA4P22748 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CA4P22748 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CA4P22748 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CA4P22748 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CA4P22748 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CA4P22748 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CA4P22748 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CA4P22748 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CA4P22748 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CA4P22748 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CA4P22748 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CA4P22748 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CA4P22748 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CA4P22748 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CA4P22748 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CA4P22748 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms