Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCP2P22307 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCP2P22307 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCP2P22307 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCP2P22307 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCP2P22307 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCP2P22307 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCP2P22307 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCP2P22307 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCP2P22307 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCP2P22307 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCP2P22307 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCP2P22307 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SCP2P22307 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCP2P22307 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCP2P22307 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SCP2P22307 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCP2P22307 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCP2P22307 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCP2P22307 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCP2P22307 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCP2P22307 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCP2P22307 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCP2P22307 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCP2P22307 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCP2P22307 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCP2P22307 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCP2P22307 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCP2P22307 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCP2P22307 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCP2P22307 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCP2P22307 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCP2P22307 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SCP2P22307 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCP2P22307 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCP2P22307 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SCP2P22307 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCP2P22307 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCP2P22307 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCP2P22307 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCP2P22307 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCP2P22307 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCP2P22307 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCP2P22307 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCP2P22307 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCP2P22307 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCP2P22307 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCP2P22307 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCP2P22307 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCP2P22307 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCP2P22307 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCP2P22307 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCP2P22307 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCP2P22307 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCP2P22307 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCP2P22307 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCP2P22307 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCP2P22307 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCP2P22307 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCP2P22307 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCP2P22307 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCP2P22307 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCP2P22307 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCP2P22307 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCP2P22307 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCP2P22307 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCP2P22307 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCP2P22307 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCP2P22307 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCP2P22307 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCP2P22307 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCP2P22307 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCP2P22307 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCP2P22307 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCP2P22307 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SCP2P22307 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCP2P22307 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCP2P22307 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCP2P22307 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCP2P22307 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SCP2P22307 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SCP2P22307 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCP2P22307 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SCP2P22307 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCP2P22307 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCP2P22307 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SCP2P22307 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCP2P22307 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCP2P22307 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCP2P22307 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCP2P22307 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCP2P22307 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCP2P22307 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCP2P22307 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCP2P22307 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SCP2P22307 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCP2P22307 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCP2P22307 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCP2P22307 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCP2P22307 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms