Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERBB3P21860 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERBB3P21860 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERBB3P21860 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERBB3P21860 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERBB3P21860 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
ERBB3P21860 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ERBB3P21860 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ERBB3P21860 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ERBB3P21860 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ERBB3P21860 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ERBB3P21860 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ERBB3P21860 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ERBB3P21860 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ERBB3P21860 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ERBB3P21860 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ERBB3P21860 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ERBB3P21860 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ERBB3P21860 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
ERBB3P21860 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ERBB3P21860 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ERBB3P21860 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ERBB3P21860 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ERBB3P21860 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ERBB3P21860 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ERBB3P21860 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
ERBB3P21860 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ERBB3P21860 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
ERBB3P21860 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ERBB3P21860 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ERBB3P21860 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ERBB3P21860 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
ERBB3P21860 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ERBB3P21860 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ERBB3P21860 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ERBB3P21860 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ERBB3P21860 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ERBB3P21860 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ERBB3P21860 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
ERBB3P21860 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ERBB3P21860 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ERBB3P21860 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
ERBB3P21860 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ERBB3P21860 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
ERBB3P21860 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ERBB3P21860 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ERBB3P21860 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ERBB3P21860 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ERBB3P21860 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ERBB3P21860 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ERBB3P21860 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ERBB3P21860 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ERBB3P21860 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ERBB3P21860 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ERBB3P21860 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ERBB3P21860 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ERBB3P21860 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ERBB3P21860 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
ERBB3P21860 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ERBB3P21860 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ERBB3P21860 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ERBB3P21860 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ERBB3P21860 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ERBB3P21860 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ERBB3P21860 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ERBB3P21860 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ERBB3P21860 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ERBB3P21860 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ERBB3P21860 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ERBB3P21860 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ERBB3P21860 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ERBB3P21860 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms