Protein–RNA interactions for Protein: P21281

ATP6V1B2, V-type proton ATPase subunit B, brain isoform, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1B2P21281 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP6V1B2P21281 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP6V1B2P21281 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP6V1B2P21281 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP6V1B2P21281 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP6V1B2P21281 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP6V1B2P21281 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP6V1B2P21281 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP6V1B2P21281 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP6V1B2P21281 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP6V1B2P21281 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP6V1B2P21281 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP6V1B2P21281 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP6V1B2P21281 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP6V1B2P21281 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP6V1B2P21281 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP6V1B2P21281 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP6V1B2P21281 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP6V1B2P21281 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP6V1B2P21281 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP6V1B2P21281 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP6V1B2P21281 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP6V1B2P21281 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP6V1B2P21281 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP6V1B2P21281 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP6V1B2P21281 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP6V1B2P21281 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP6V1B2P21281 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP6V1B2P21281 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP6V1B2P21281 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP6V1B2P21281 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP6V1B2P21281 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP6V1B2P21281 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP6V1B2P21281 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP6V1B2P21281 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP6V1B2P21281 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP6V1B2P21281 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP6V1B2P21281 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP6V1B2P21281 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP6V1B2P21281 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP6V1B2P21281 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP6V1B2P21281 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP6V1B2P21281 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP6V1B2P21281 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP6V1B2P21281 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP6V1B2P21281 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP6V1B2P21281 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6V1B2P21281 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6V1B2P21281 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6V1B2P21281 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6V1B2P21281 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6V1B2P21281 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP6V1B2P21281 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP6V1B2P21281 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP6V1B2P21281 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP6V1B2P21281 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6V1B2P21281 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6V1B2P21281 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6V1B2P21281 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6V1B2P21281 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6V1B2P21281 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6V1B2P21281 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6V1B2P21281 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6V1B2P21281 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6V1B2P21281 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6V1B2P21281 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6V1B2P21281 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.3 ms