Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPL17P18621 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RPL17P18621 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RPL17P18621 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPL17P18621 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPL17P18621 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPL17P18621 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPL17P18621 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RPL17P18621 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPL17P18621 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPL17P18621 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPL17P18621 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPL17P18621 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RPL17P18621 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RPL17P18621 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPL17P18621 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPL17P18621 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPL17P18621 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPL17P18621 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPL17P18621 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPL17P18621 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPL17P18621 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPL17P18621 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPL17P18621 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPL17P18621 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPL17P18621 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPL17P18621 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPL17P18621 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPL17P18621 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPL17P18621 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RPL17P18621 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPL17P18621 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPL17P18621 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPL17P18621 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPL17P18621 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPL17P18621 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPL17P18621 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPL17P18621 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPL17P18621 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPL17P18621 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPL17P18621 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPL17P18621 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPL17P18621 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPL17P18621 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPL17P18621 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPL17P18621 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPL17P18621 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPL17P18621 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPL17P18621 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPL17P18621 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPL17P18621 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPL17P18621 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RPL17P18621 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPL17P18621 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RPL17P18621 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPL17P18621 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPL17P18621 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RPL17P18621 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPL17P18621 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPL17P18621 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPL17P18621 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPL17P18621 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RPL17P18621 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPL17P18621 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPL17P18621 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPL17P18621 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPL17P18621 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPL17P18621 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPL17P18621 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPL17P18621 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPL17P18621 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPL17P18621 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPL17P18621 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPL17P18621 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPL17P18621 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPL17P18621 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPL17P18621 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPL17P18621 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPL17P18621 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPL17P18621 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPL17P18621 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RPL17P18621 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPL17P18621 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPL17P18621 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPL17P18621 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RPL17P18621 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RPL17P18621 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPL17P18621 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPL17P18621 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPL17P18621 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPL17P18621 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPL17P18621 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPL17P18621 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPL17P18621 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RPL17P18621 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RPL17P18621 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RPL17P18621 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RPL17P18621 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPL17P18621 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPL17P18621 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms