Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLS3P13797 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLS3P13797 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PLS3P13797 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLS3P13797 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLS3P13797 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLS3P13797 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLS3P13797 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLS3P13797 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PLS3P13797 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PLS3P13797 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PLS3P13797 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLS3P13797 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLS3P13797 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLS3P13797 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLS3P13797 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLS3P13797 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLS3P13797 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLS3P13797 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLS3P13797 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLS3P13797 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PLS3P13797 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLS3P13797 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PLS3P13797 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PLS3P13797 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLS3P13797 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLS3P13797 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PLS3P13797 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLS3P13797 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLS3P13797 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
PLS3P13797 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLS3P13797 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLS3P13797 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLS3P13797 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLS3P13797 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLS3P13797 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PLS3P13797 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLS3P13797 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLS3P13797 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLS3P13797 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLS3P13797 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLS3P13797 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLS3P13797 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLS3P13797 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLS3P13797 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLS3P13797 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLS3P13797 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLS3P13797 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLS3P13797 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLS3P13797 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLS3P13797 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLS3P13797 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLS3P13797 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLS3P13797 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLS3P13797 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLS3P13797 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLS3P13797 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLS3P13797 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLS3P13797 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLS3P13797 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLS3P13797 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLS3P13797 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLS3P13797 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLS3P13797 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLS3P13797 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLS3P13797 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLS3P13797 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLS3P13797 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLS3P13797 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLS3P13797 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLS3P13797 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLS3P13797 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLS3P13797 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLS3P13797 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLS3P13797 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLS3P13797 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PLS3P13797 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLS3P13797 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLS3P13797 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PLS3P13797 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLS3P13797 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLS3P13797 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLS3P13797 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLS3P13797 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLS3P13797 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLS3P13797 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLS3P13797 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PLS3P13797 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PLS3P13797 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLS3P13797 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLS3P13797 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLS3P13797 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLS3P13797 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLS3P13797 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLS3P13797 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLS3P13797 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLS3P13797 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLS3P13797 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLS3P13797 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLS3P13797 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms