Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH1P12830 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH1P12830 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH1P12830 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH1P12830 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH1P12830 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH1P12830 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH1P12830 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH1P12830 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH1P12830 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH1P12830 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH1P12830 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH1P12830 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH1P12830 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH1P12830 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH1P12830 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH1P12830 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH1P12830 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH1P12830 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH1P12830 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH1P12830 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH1P12830 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH1P12830 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH1P12830 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH1P12830 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH1P12830 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH1P12830 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH1P12830 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH1P12830 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH1P12830 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH1P12830 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH1P12830 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH1P12830 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH1P12830 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH1P12830 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH1P12830 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH1P12830 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH1P12830 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH1P12830 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH1P12830 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH1P12830 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH1P12830 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH1P12830 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH1P12830 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH1P12830 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH1P12830 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH1P12830 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH1P12830 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH1P12830 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH1P12830 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH1P12830 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH1P12830 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH1P12830 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH1P12830 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH1P12830 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH1P12830 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH1P12830 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH1P12830 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH1P12830 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH1P12830 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH1P12830 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH1P12830 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH1P12830 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH1P12830 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH1P12830 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH1P12830 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH1P12830 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH1P12830 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH1P12830 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH1P12830 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH1P12830 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH1P12830 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH1P12830 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH1P12830 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH1P12830 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH1P12830 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH1P12830 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH1P12830 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH1P12830 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH1P12830 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH1P12830 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH1P12830 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH1P12830 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH1P12830 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH1P12830 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH1P12830 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH1P12830 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH1P12830 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH1P12830 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH1P12830 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH1P12830 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH1P12830 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH1P12830 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH1P12830 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH1P12830 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH1P12830 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH1P12830 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH1P12830 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH1P12830 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH1P12830 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms