Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COX6A1P12074 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COX6A1P12074 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COX6A1P12074 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COX6A1P12074 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COX6A1P12074 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COX6A1P12074 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COX6A1P12074 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COX6A1P12074 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COX6A1P12074 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COX6A1P12074 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COX6A1P12074 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COX6A1P12074 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COX6A1P12074 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COX6A1P12074 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COX6A1P12074 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COX6A1P12074 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COX6A1P12074 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COX6A1P12074 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COX6A1P12074 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COX6A1P12074 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COX6A1P12074 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COX6A1P12074 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COX6A1P12074 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COX6A1P12074 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COX6A1P12074 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COX6A1P12074 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COX6A1P12074 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COX6A1P12074 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COX6A1P12074 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COX6A1P12074 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COX6A1P12074 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COX6A1P12074 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COX6A1P12074 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COX6A1P12074 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms