Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THRAP10827 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THRAP10827 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THRAP10827 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THRAP10827 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THRAP10827 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THRAP10827 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THRAP10827 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THRAP10827 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THRAP10827 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THRAP10827 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THRAP10827 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THRAP10827 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THRAP10827 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THRAP10827 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THRAP10827 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THRAP10827 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THRAP10827 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THRAP10827 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THRAP10827 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THRAP10827 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THRAP10827 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
THRAP10827 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
THRAP10827 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
THRAP10827 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
THRAP10827 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THRAP10827 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THRAP10827 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP10827 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP10827 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP10827 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP10827 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP10827 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP10827 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP10827 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP10827 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP10827 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP10827 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP10827 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP10827 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP10827 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP10827 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
THRAP10827 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
THRAP10827 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THRAP10827 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THRAP10827 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
THRAP10827 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
THRAP10827 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
THRAP10827 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
THRAP10827 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
THRAP10827 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
THRAP10827 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
THRAP10827 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
THRAP10827 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
THRAP10827 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
THRAP10827 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
THRAP10827 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
THRAP10827 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
THRAP10827 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
THRAP10827 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
THRAP10827 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
THRAP10827 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
THRAP10827 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
THRAP10827 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
THRAP10827 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
THRAP10827 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
THRAP10827 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
THRAP10827 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
THRAP10827 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP10827 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP10827 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP10827 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP10827 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP10827 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
THRAP10827 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
THRAP10827 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
THRAP10827 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
THRAP10827 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
THRAP10827 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
THRAP10827 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
THRAP10827 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
THRAP10827 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THRAP10827 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
THRAP10827 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
THRAP10827 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THRAP10827 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THRAP10827 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
THRAP10827 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
THRAP10827 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
THRAP10827 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP10827 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
THRAP10827 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THRAP10827 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
THRAP10827 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THRAP10827 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
THRAP10827 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
THRAP10827 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
THRAP10827 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
THRAP10827 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
THRAP10827 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.4 ms