Protein–RNA interactions for Protein: P10600

TGFB3, Transforming growth factor beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3P10600 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TGFB3P10600 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TGFB3P10600 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TGFB3P10600 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TGFB3P10600 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TGFB3P10600 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TGFB3P10600 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TGFB3P10600 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TGFB3P10600 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TGFB3P10600 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TGFB3P10600 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TGFB3P10600 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TGFB3P10600 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TGFB3P10600 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TGFB3P10600 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TGFB3P10600 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TGFB3P10600 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TGFB3P10600 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TGFB3P10600 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TGFB3P10600 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TGFB3P10600 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TGFB3P10600 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TGFB3P10600 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TGFB3P10600 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TGFB3P10600 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TGFB3P10600 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TGFB3P10600 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TGFB3P10600 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TGFB3P10600 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TGFB3P10600 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TGFB3P10600 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TGFB3P10600 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TGFB3P10600 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TGFB3P10600 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TGFB3P10600 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TGFB3P10600 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TGFB3P10600 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TGFB3P10600 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TGFB3P10600 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TGFB3P10600 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TGFB3P10600 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TGFB3P10600 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TGFB3P10600 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TGFB3P10600 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TGFB3P10600 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
TGFB3P10600 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TGFB3P10600 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TGFB3P10600 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TGFB3P10600 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TGFB3P10600 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TGFB3P10600 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TGFB3P10600 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TGFB3P10600 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TGFB3P10600 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TGFB3P10600 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TGFB3P10600 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TGFB3P10600 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TGFB3P10600 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TGFB3P10600 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TGFB3P10600 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TGFB3P10600 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TGFB3P10600 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TGFB3P10600 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TGFB3P10600 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TGFB3P10600 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TGFB3P10600 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TGFB3P10600 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
TGFB3P10600 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TGFB3P10600 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TGFB3P10600 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TGFB3P10600 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TGFB3P10600 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TGFB3P10600 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TGFB3P10600 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TGFB3P10600 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TGFB3P10600 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TGFB3P10600 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TGFB3P10600 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TGFB3P10600 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TGFB3P10600 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TGFB3P10600 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TGFB3P10600 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TGFB3P10600 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TGFB3P10600 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TGFB3P10600 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TGFB3P10600 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TGFB3P10600 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TGFB3P10600 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TGFB3P10600 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TGFB3P10600 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TGFB3P10600 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TGFB3P10600 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TGFB3P10600 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TGFB3P10600 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TGFB3P10600 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TGFB3P10600 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TGFB3P10600 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TGFB3P10600 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TGFB3P10600 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TGFB3P10600 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms