Protein–RNA interactions for Protein: P0DKV0

SPATA31C1, Spermatogenesis-associated protein 31C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA31C1P0DKV0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPATA31C1P0DKV0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPATA31C1P0DKV0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPATA31C1P0DKV0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPATA31C1P0DKV0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPATA31C1P0DKV0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPATA31C1P0DKV0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPATA31C1P0DKV0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPATA31C1P0DKV0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SPATA31C1P0DKV0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPATA31C1P0DKV0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SPATA31C1P0DKV0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SPATA31C1P0DKV0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPATA31C1P0DKV0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SPATA31C1P0DKV0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPATA31C1P0DKV0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPATA31C1P0DKV0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPATA31C1P0DKV0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPATA31C1P0DKV0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPATA31C1P0DKV0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPATA31C1P0DKV0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPATA31C1P0DKV0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPATA31C1P0DKV0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPATA31C1P0DKV0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPATA31C1P0DKV0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPATA31C1P0DKV0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPATA31C1P0DKV0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPATA31C1P0DKV0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPATA31C1P0DKV0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPATA31C1P0DKV0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPATA31C1P0DKV0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPATA31C1P0DKV0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPATA31C1P0DKV0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPATA31C1P0DKV0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SPATA31C1P0DKV0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPATA31C1P0DKV0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPATA31C1P0DKV0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPATA31C1P0DKV0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPATA31C1P0DKV0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPATA31C1P0DKV0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPATA31C1P0DKV0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPATA31C1P0DKV0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPATA31C1P0DKV0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPATA31C1P0DKV0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SPATA31C1P0DKV0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPATA31C1P0DKV0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPATA31C1P0DKV0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPATA31C1P0DKV0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPATA31C1P0DKV0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPATA31C1P0DKV0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPATA31C1P0DKV0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPATA31C1P0DKV0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPATA31C1P0DKV0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPATA31C1P0DKV0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPATA31C1P0DKV0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPATA31C1P0DKV0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SPATA31C1P0DKV0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPATA31C1P0DKV0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPATA31C1P0DKV0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPATA31C1P0DKV0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPATA31C1P0DKV0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPATA31C1P0DKV0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPATA31C1P0DKV0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPATA31C1P0DKV0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPATA31C1P0DKV0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SPATA31C1P0DKV0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPATA31C1P0DKV0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPATA31C1P0DKV0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPATA31C1P0DKV0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPATA31C1P0DKV0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPATA31C1P0DKV0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SPATA31C1P0DKV0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms