Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RD3LP0DJH9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RD3LP0DJH9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RD3LP0DJH9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RD3LP0DJH9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RD3LP0DJH9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RD3LP0DJH9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RD3LP0DJH9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RD3LP0DJH9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RD3LP0DJH9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RD3LP0DJH9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RD3LP0DJH9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RD3LP0DJH9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RD3LP0DJH9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RD3LP0DJH9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RD3LP0DJH9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RD3LP0DJH9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RD3LP0DJH9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RD3LP0DJH9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RD3LP0DJH9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RD3LP0DJH9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RD3LP0DJH9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RD3LP0DJH9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RD3LP0DJH9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RD3LP0DJH9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RD3LP0DJH9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RD3LP0DJH9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RD3LP0DJH9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RD3LP0DJH9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RD3LP0DJH9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RD3LP0DJH9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RD3LP0DJH9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RD3LP0DJH9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RD3LP0DJH9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RD3LP0DJH9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms