Protein–RNA interactions for Protein: P0C860

MSL3P1, Putative male-specific lethal-3 protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3P1P0C860 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSL3P1P0C860 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSL3P1P0C860 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSL3P1P0C860 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MSL3P1P0C860 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSL3P1P0C860 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSL3P1P0C860 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MSL3P1P0C860 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSL3P1P0C860 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MSL3P1P0C860 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSL3P1P0C860 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSL3P1P0C860 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSL3P1P0C860 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSL3P1P0C860 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSL3P1P0C860 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSL3P1P0C860 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSL3P1P0C860 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSL3P1P0C860 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSL3P1P0C860 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSL3P1P0C860 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSL3P1P0C860 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSL3P1P0C860 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSL3P1P0C860 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSL3P1P0C860 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSL3P1P0C860 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSL3P1P0C860 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSL3P1P0C860 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSL3P1P0C860 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSL3P1P0C860 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSL3P1P0C860 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSL3P1P0C860 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MSL3P1P0C860 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MSL3P1P0C860 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSL3P1P0C860 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSL3P1P0C860 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSL3P1P0C860 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSL3P1P0C860 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSL3P1P0C860 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms