Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
POLA1P09884 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
POLA1P09884 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
POLA1P09884 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
POLA1P09884 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
POLA1P09884 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
POLA1P09884 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC43.5■■■■■ 4.55
POLA1P09884 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
POLA1P09884 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC43.5■■■■■ 4.55
POLA1P09884 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
POLA1P09884 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
POLA1P09884 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
POLA1P09884 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
POLA1P09884 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
POLA1P09884 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
POLA1P09884 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
POLA1P09884 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
POLA1P09884 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
POLA1P09884 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
POLA1P09884 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
POLA1P09884 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
POLA1P09884 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
POLA1P09884 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC43.42■■■■■ 4.54
POLA1P09884 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.42■■■■■ 4.54
POLA1P09884 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
POLA1P09884 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
POLA1P09884 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
POLA1P09884 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
POLA1P09884 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
POLA1P09884 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
POLA1P09884 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
POLA1P09884 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
POLA1P09884 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.54
POLA1P09884 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC43.38■■■■■ 4.53
POLA1P09884 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC43.38■■■■■ 4.53
POLA1P09884 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
POLA1P09884 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
POLA1P09884 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
POLA1P09884 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC43.36■■■■■ 4.53
POLA1P09884 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
POLA1P09884 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
POLA1P09884 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
POLA1P09884 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
POLA1P09884 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
POLA1P09884 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
POLA1P09884 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC43.34■■■■■ 4.53
POLA1P09884 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
POLA1P09884 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
POLA1P09884 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
POLA1P09884 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC43.32■■■■■ 4.52
POLA1P09884 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
POLA1P09884 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
POLA1P09884 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
POLA1P09884 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.29■■■■■ 4.52
POLA1P09884 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
POLA1P09884 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC43.29■■■■■ 4.52
POLA1P09884 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
POLA1P09884 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
POLA1P09884 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
POLA1P09884 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
POLA1P09884 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
POLA1P09884 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
POLA1P09884 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
POLA1P09884 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
POLA1P09884 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
POLA1P09884 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
POLA1P09884 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC43.23■■■■■ 4.51
POLA1P09884 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
POLA1P09884 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
POLA1P09884 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
POLA1P09884 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
POLA1P09884 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
POLA1P09884 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.5
POLA1P09884 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
POLA1P09884 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.5
POLA1P09884 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC43.17■■■■■ 4.5
POLA1P09884 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
POLA1P09884 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
POLA1P09884 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC43.16■■■■■ 4.5
POLA1P09884 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
POLA1P09884 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
POLA1P09884 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
POLA1P09884 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
POLA1P09884 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC43.14■■■■■ 4.5
POLA1P09884 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
POLA1P09884 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
POLA1P09884 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
POLA1P09884 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.5
POLA1P09884 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
POLA1P09884 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
POLA1P09884 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
POLA1P09884 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
POLA1P09884 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
POLA1P09884 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
POLA1P09884 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
POLA1P09884 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
POLA1P09884 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
POLA1P09884 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
POLA1P09884 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
POLA1P09884 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 925 ms