Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACAA1P09110 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAA1P09110 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACAA1P09110 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms