Protein–RNA interactions for Protein: P08237

PFKM, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKMP08237 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PFKMP08237 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PFKMP08237 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PFKMP08237 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PFKMP08237 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PFKMP08237 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PFKMP08237 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PFKMP08237 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PFKMP08237 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PFKMP08237 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PFKMP08237 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PFKMP08237 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PFKMP08237 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PFKMP08237 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PFKMP08237 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PFKMP08237 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PFKMP08237 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PFKMP08237 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PFKMP08237 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PFKMP08237 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PFKMP08237 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PFKMP08237 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PFKMP08237 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PFKMP08237 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PFKMP08237 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PFKMP08237 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PFKMP08237 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PFKMP08237 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PFKMP08237 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PFKMP08237 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PFKMP08237 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PFKMP08237 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PFKMP08237 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PFKMP08237 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PFKMP08237 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PFKMP08237 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PFKMP08237 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PFKMP08237 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PFKMP08237 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PFKMP08237 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PFKMP08237 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PFKMP08237 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PFKMP08237 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PFKMP08237 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PFKMP08237 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PFKMP08237 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PFKMP08237 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PFKMP08237 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PFKMP08237 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PFKMP08237 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PFKMP08237 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PFKMP08237 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PFKMP08237 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PFKMP08237 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PFKMP08237 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PFKMP08237 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PFKMP08237 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PFKMP08237 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PFKMP08237 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PFKMP08237 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PFKMP08237 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PFKMP08237 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PFKMP08237 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PFKMP08237 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PFKMP08237 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PFKMP08237 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PFKMP08237 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PFKMP08237 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PFKMP08237 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PFKMP08237 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PFKMP08237 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PFKMP08237 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PFKMP08237 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PFKMP08237 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PFKMP08237 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PFKMP08237 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PFKMP08237 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PFKMP08237 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PFKMP08237 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PFKMP08237 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PFKMP08237 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PFKMP08237 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PFKMP08237 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PFKMP08237 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PFKMP08237 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PFKMP08237 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PFKMP08237 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PFKMP08237 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PFKMP08237 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PFKMP08237 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PFKMP08237 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PFKMP08237 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PFKMP08237 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PFKMP08237 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PFKMP08237 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PFKMP08237 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PFKMP08237 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PFKMP08237 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PFKMP08237 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PFKMP08237 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms