Protein–RNA interactions for Protein: P07858

CTSB, Cathepsin B, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSBP07858 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSBP07858 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSBP07858 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSBP07858 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSBP07858 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSBP07858 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSBP07858 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSBP07858 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSBP07858 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSBP07858 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSBP07858 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSBP07858 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSBP07858 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSBP07858 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSBP07858 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSBP07858 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSBP07858 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSBP07858 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSBP07858 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSBP07858 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSBP07858 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSBP07858 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSBP07858 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSBP07858 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSBP07858 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSBP07858 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSBP07858 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSBP07858 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSBP07858 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSBP07858 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSBP07858 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSBP07858 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSBP07858 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSBP07858 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSBP07858 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSBP07858 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSBP07858 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSBP07858 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSBP07858 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSBP07858 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSBP07858 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSBP07858 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSBP07858 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSBP07858 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSBP07858 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSBP07858 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSBP07858 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSBP07858 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSBP07858 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSBP07858 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSBP07858 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSBP07858 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSBP07858 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSBP07858 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSBP07858 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSBP07858 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSBP07858 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSBP07858 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSBP07858 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSBP07858 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTSBP07858 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTSBP07858 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSBP07858 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSBP07858 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSBP07858 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSBP07858 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSBP07858 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSBP07858 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSBP07858 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSBP07858 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSBP07858 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSBP07858 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSBP07858 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSBP07858 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSBP07858 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSBP07858 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSBP07858 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSBP07858 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSBP07858 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSBP07858 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSBP07858 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSBP07858 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSBP07858 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSBP07858 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSBP07858 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSBP07858 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSBP07858 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSBP07858 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSBP07858 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSBP07858 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTSBP07858 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSBP07858 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSBP07858 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSBP07858 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSBP07858 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSBP07858 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSBP07858 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSBP07858 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSBP07858 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSBP07858 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms