Protein–RNA interactions for Protein: P06731

CEACAM5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM5P06731 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEACAM5P06731 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEACAM5P06731 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEACAM5P06731 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEACAM5P06731 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEACAM5P06731 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEACAM5P06731 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEACAM5P06731 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEACAM5P06731 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEACAM5P06731 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEACAM5P06731 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEACAM5P06731 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEACAM5P06731 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEACAM5P06731 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEACAM5P06731 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEACAM5P06731 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEACAM5P06731 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CEACAM5P06731 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEACAM5P06731 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEACAM5P06731 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEACAM5P06731 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEACAM5P06731 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEACAM5P06731 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEACAM5P06731 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEACAM5P06731 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CEACAM5P06731 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEACAM5P06731 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEACAM5P06731 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEACAM5P06731 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEACAM5P06731 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEACAM5P06731 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEACAM5P06731 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEACAM5P06731 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEACAM5P06731 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CEACAM5P06731 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEACAM5P06731 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEACAM5P06731 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEACAM5P06731 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEACAM5P06731 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEACAM5P06731 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEACAM5P06731 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CEACAM5P06731 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEACAM5P06731 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEACAM5P06731 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CEACAM5P06731 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms