Protein–RNA interactions for Protein: P06400

RB1, Retinoblastoma-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1P06400 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RB1P06400 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RB1P06400 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RB1P06400 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RB1P06400 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RB1P06400 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RB1P06400 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RB1P06400 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RB1P06400 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RB1P06400 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RB1P06400 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RB1P06400 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RB1P06400 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RB1P06400 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RB1P06400 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RB1P06400 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RB1P06400 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RB1P06400 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RB1P06400 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RB1P06400 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RB1P06400 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RB1P06400 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RB1P06400 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RB1P06400 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RB1P06400 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RB1P06400 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RB1P06400 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RB1P06400 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RB1P06400 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RB1P06400 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RB1P06400 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RB1P06400 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RB1P06400 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RB1P06400 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RB1P06400 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RB1P06400 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RB1P06400 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RB1P06400 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RB1P06400 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RB1P06400 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RB1P06400 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RB1P06400 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RB1P06400 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RB1P06400 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RB1P06400 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RB1P06400 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RB1P06400 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RB1P06400 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RB1P06400 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RB1P06400 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RB1P06400 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RB1P06400 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RB1P06400 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RB1P06400 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RB1P06400 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RB1P06400 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RB1P06400 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RB1P06400 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RB1P06400 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RB1P06400 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RB1P06400 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RB1P06400 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RB1P06400 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RB1P06400 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RB1P06400 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RB1P06400 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RB1P06400 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RB1P06400 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RB1P06400 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RB1P06400 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RB1P06400 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RB1P06400 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RB1P06400 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RB1P06400 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RB1P06400 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RB1P06400 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RB1P06400 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RB1P06400 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RB1P06400 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RB1P06400 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RB1P06400 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RB1P06400 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RB1P06400 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RB1P06400 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RB1P06400 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RB1P06400 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RB1P06400 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RB1P06400 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RB1P06400 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RB1P06400 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RB1P06400 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RB1P06400 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RB1P06400 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RB1P06400 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RB1P06400 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RB1P06400 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RB1P06400 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RB1P06400 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RB1P06400 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RB1P06400 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms