Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGF1P05230 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGF1P05230 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGF1P05230 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGF1P05230 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGF1P05230 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGF1P05230 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGF1P05230 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGF1P05230 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGF1P05230 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGF1P05230 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGF1P05230 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGF1P05230 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGF1P05230 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGF1P05230 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGF1P05230 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FGF1P05230 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGF1P05230 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGF1P05230 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGF1P05230 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
FGF1P05230 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGF1P05230 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGF1P05230 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGF1P05230 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FGF1P05230 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FGF1P05230 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FGF1P05230 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGF1P05230 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGF1P05230 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGF1P05230 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGF1P05230 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGF1P05230 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGF1P05230 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGF1P05230 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGF1P05230 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGF1P05230 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGF1P05230 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGF1P05230 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGF1P05230 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FGF1P05230 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGF1P05230 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FGF1P05230 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGF1P05230 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGF1P05230 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGF1P05230 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGF1P05230 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGF1P05230 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGF1P05230 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGF1P05230 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGF1P05230 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGF1P05230 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FGF1P05230 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGF1P05230 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGF1P05230 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FGF1P05230 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGF1P05230 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGF1P05230 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGF1P05230 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGF1P05230 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FGF1P05230 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGF1P05230 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGF1P05230 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGF1P05230 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGF1P05230 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGF1P05230 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FGF1P05230 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGF1P05230 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGF1P05230 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGF1P05230 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGF1P05230 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGF1P05230 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGF1P05230 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGF1P05230 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGF1P05230 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGF1P05230 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGF1P05230 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGF1P05230 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGF1P05230 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FGF1P05230 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGF1P05230 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGF1P05230 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGF1P05230 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGF1P05230 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGF1P05230 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGF1P05230 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FGF1P05230 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FGF1P05230 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGF1P05230 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGF1P05230 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGF1P05230 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FGF1P05230 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FGF1P05230 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FGF1P05230 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FGF1P05230 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FGF1P05230 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FGF1P05230 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FGF1P05230 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FGF1P05230 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FGF1P05230 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGF1P05230 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms