Protein–RNA interactions for Protein: P04233

CD74, HLA class II histocompatibility antigen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD74P04233 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD74P04233 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD74P04233 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD74P04233 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD74P04233 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD74P04233 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CD74P04233 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD74P04233 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD74P04233 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD74P04233 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD74P04233 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD74P04233 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD74P04233 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD74P04233 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD74P04233 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD74P04233 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD74P04233 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD74P04233 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD74P04233 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD74P04233 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CD74P04233 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD74P04233 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD74P04233 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD74P04233 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD74P04233 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD74P04233 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD74P04233 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD74P04233 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD74P04233 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD74P04233 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD74P04233 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD74P04233 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CD74P04233 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CD74P04233 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD74P04233 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD74P04233 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD74P04233 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CD74P04233 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD74P04233 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD74P04233 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD74P04233 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CD74P04233 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD74P04233 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD74P04233 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD74P04233 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CD74P04233 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CD74P04233 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD74P04233 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD74P04233 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD74P04233 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD74P04233 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD74P04233 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD74P04233 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD74P04233 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD74P04233 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD74P04233 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD74P04233 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD74P04233 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD74P04233 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD74P04233 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD74P04233 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD74P04233 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD74P04233 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD74P04233 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CD74P04233 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD74P04233 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD74P04233 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD74P04233 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD74P04233 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD74P04233 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD74P04233 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD74P04233 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD74P04233 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD74P04233 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD74P04233 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD74P04233 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD74P04233 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD74P04233 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD74P04233 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD74P04233 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD74P04233 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD74P04233 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD74P04233 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD74P04233 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD74P04233 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD74P04233 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD74P04233 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD74P04233 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD74P04233 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD74P04233 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD74P04233 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD74P04233 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CD74P04233 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD74P04233 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD74P04233 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD74P04233 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD74P04233 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD74P04233 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD74P04233 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD74P04233 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms