Protein–RNA interactions for Protein: P04035

HMGCR, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCRP04035 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HMGCRP04035 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HMGCRP04035 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HMGCRP04035 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HMGCRP04035 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HMGCRP04035 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HMGCRP04035 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HMGCRP04035 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HMGCRP04035 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HMGCRP04035 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HMGCRP04035 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HMGCRP04035 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HMGCRP04035 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HMGCRP04035 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HMGCRP04035 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HMGCRP04035 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
HMGCRP04035 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HMGCRP04035 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HMGCRP04035 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HMGCRP04035 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HMGCRP04035 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HMGCRP04035 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HMGCRP04035 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HMGCRP04035 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HMGCRP04035 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HMGCRP04035 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HMGCRP04035 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HMGCRP04035 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HMGCRP04035 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HMGCRP04035 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HMGCRP04035 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HMGCRP04035 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HMGCRP04035 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HMGCRP04035 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HMGCRP04035 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HMGCRP04035 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HMGCRP04035 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HMGCRP04035 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HMGCRP04035 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HMGCRP04035 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HMGCRP04035 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29■■■□□ 2.23
HMGCRP04035 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HMGCRP04035 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HMGCRP04035 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HMGCRP04035 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HMGCRP04035 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HMGCRP04035 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HMGCRP04035 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HMGCRP04035 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HMGCRP04035 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HMGCRP04035 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HMGCRP04035 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HMGCRP04035 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HMGCRP04035 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HMGCRP04035 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HMGCRP04035 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HMGCRP04035 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
HMGCRP04035 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HMGCRP04035 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HMGCRP04035 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
HMGCRP04035 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HMGCRP04035 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HMGCRP04035 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HMGCRP04035 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HMGCRP04035 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HMGCRP04035 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HMGCRP04035 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HMGCRP04035 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
HMGCRP04035 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HMGCRP04035 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HMGCRP04035 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms