Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VTNP04004 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VTNP04004 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VTNP04004 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VTNP04004 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VTNP04004 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VTNP04004 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VTNP04004 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VTNP04004 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VTNP04004 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VTNP04004 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VTNP04004 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VTNP04004 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VTNP04004 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VTNP04004 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VTNP04004 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VTNP04004 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
VTNP04004 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VTNP04004 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VTNP04004 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VTNP04004 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VTNP04004 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VTNP04004 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
VTNP04004 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VTNP04004 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
VTNP04004 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VTNP04004 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VTNP04004 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VTNP04004 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VTNP04004 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VTNP04004 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VTNP04004 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VTNP04004 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VTNP04004 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VTNP04004 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VTNP04004 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
VTNP04004 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VTNP04004 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VTNP04004 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
VTNP04004 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
VTNP04004 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VTNP04004 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VTNP04004 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VTNP04004 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VTNP04004 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
VTNP04004 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VTNP04004 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VTNP04004 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
VTNP04004 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VTNP04004 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VTNP04004 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VTNP04004 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VTNP04004 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VTNP04004 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VTNP04004 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VTNP04004 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VTNP04004 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
VTNP04004 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
VTNP04004 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VTNP04004 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VTNP04004 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VTNP04004 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VTNP04004 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VTNP04004 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VTNP04004 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VTNP04004 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VTNP04004 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VTNP04004 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VTNP04004 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VTNP04004 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VTNP04004 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VTNP04004 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
VTNP04004 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VTNP04004 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VTNP04004 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VTNP04004 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VTNP04004 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VTNP04004 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VTNP04004 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VTNP04004 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VTNP04004 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VTNP04004 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VTNP04004 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
VTNP04004 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VTNP04004 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VTNP04004 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VTNP04004 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VTNP04004 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VTNP04004 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VTNP04004 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VTNP04004 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VTNP04004 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
VTNP04004 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VTNP04004 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VTNP04004 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VTNP04004 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VTNP04004 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VTNP04004 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VTNP04004 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VTNP04004 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms