Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VIPP01282 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
VIPP01282 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VIPP01282 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIPP01282 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIPP01282 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIPP01282 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIPP01282 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIPP01282 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIPP01282 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIPP01282 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIPP01282 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIPP01282 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIPP01282 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIPP01282 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIPP01282 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VIPP01282 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIPP01282 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIPP01282 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VIPP01282 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VIPP01282 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIPP01282 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIPP01282 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIPP01282 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIPP01282 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIPP01282 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIPP01282 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIPP01282 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIPP01282 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIPP01282 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIPP01282 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIPP01282 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIPP01282 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIPP01282 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIPP01282 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIPP01282 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VIPP01282 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VIPP01282 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VIPP01282 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VIPP01282 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VIPP01282 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VIPP01282 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VIPP01282 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VIPP01282 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VIPP01282 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VIPP01282 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VIPP01282 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VIPP01282 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VIPP01282 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VIPP01282 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VIPP01282 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VIPP01282 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VIPP01282 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VIPP01282 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VIPP01282 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VIPP01282 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VIPP01282 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VIPP01282 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VIPP01282 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VIPP01282 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VIPP01282 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VIPP01282 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VIPP01282 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VIPP01282 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VIPP01282 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VIPP01282 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VIPP01282 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VIPP01282 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VIPP01282 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VIPP01282 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIPP01282 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIPP01282 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIPP01282 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIPP01282 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIPP01282 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIPP01282 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIPP01282 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIPP01282 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIPP01282 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIPP01282 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIPP01282 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIPP01282 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIPP01282 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIPP01282 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIPP01282 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIPP01282 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIPP01282 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIPP01282 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIPP01282 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VIPP01282 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VIPP01282 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VIPP01282 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VIPP01282 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIPP01282 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIPP01282 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIPP01282 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIPP01282 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIPP01282 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIPP01282 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIPP01282 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms