Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
F9P00740 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
F9P00740 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
F9P00740 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
F9P00740 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
F9P00740 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
F9P00740 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
F9P00740 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
F9P00740 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
F9P00740 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
F9P00740 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
F9P00740 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
F9P00740 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
F9P00740 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
F9P00740 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
F9P00740 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
F9P00740 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
F9P00740 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
F9P00740 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
F9P00740 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
F9P00740 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
F9P00740 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
F9P00740 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
F9P00740 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
F9P00740 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
F9P00740 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
F9P00740 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
F9P00740 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
F9P00740 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
F9P00740 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
F9P00740 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
F9P00740 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
F9P00740 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
F9P00740 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
F9P00740 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
F9P00740 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
F9P00740 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
F9P00740 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
F9P00740 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
F9P00740 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
F9P00740 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
F9P00740 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
F9P00740 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
F9P00740 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
F9P00740 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
F9P00740 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
F9P00740 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
F9P00740 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
F9P00740 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
F9P00740 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
F9P00740 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
F9P00740 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
F9P00740 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
F9P00740 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
F9P00740 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
F9P00740 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
F9P00740 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
F9P00740 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
F9P00740 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
F9P00740 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
F9P00740 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
F9P00740 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
F9P00740 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
F9P00740 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
F9P00740 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
F9P00740 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
F9P00740 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
F9P00740 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
F9P00740 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
F9P00740 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
F9P00740 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
F9P00740 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
F9P00740 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
F9P00740 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
F9P00740 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
F9P00740 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
F9P00740 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
F9P00740 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
F9P00740 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
F9P00740 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
F9P00740 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
F9P00740 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
F9P00740 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
F9P00740 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
F9P00740 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
F9P00740 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
F9P00740 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
F9P00740 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
F9P00740 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
F9P00740 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
F9P00740 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
F9P00740 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
F9P00740 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
F9P00740 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
F9P00740 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
F9P00740 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
F9P00740 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
F9P00740 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
F9P00740 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
F9P00740 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms