Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
F13A1P00488 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
F13A1P00488 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
F13A1P00488 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
F13A1P00488 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
F13A1P00488 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
F13A1P00488 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
F13A1P00488 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
F13A1P00488 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
F13A1P00488 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
F13A1P00488 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
F13A1P00488 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
F13A1P00488 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
F13A1P00488 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
F13A1P00488 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
F13A1P00488 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
F13A1P00488 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
F13A1P00488 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
F13A1P00488 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
F13A1P00488 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
F13A1P00488 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
F13A1P00488 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
F13A1P00488 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
F13A1P00488 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
F13A1P00488 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
F13A1P00488 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
F13A1P00488 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
F13A1P00488 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
F13A1P00488 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
F13A1P00488 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
F13A1P00488 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
F13A1P00488 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
F13A1P00488 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
F13A1P00488 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
F13A1P00488 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
F13A1P00488 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
F13A1P00488 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
F13A1P00488 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
F13A1P00488 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
F13A1P00488 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
F13A1P00488 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
F13A1P00488 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
F13A1P00488 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
F13A1P00488 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
F13A1P00488 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
F13A1P00488 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
F13A1P00488 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
F13A1P00488 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
F13A1P00488 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
F13A1P00488 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
F13A1P00488 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
F13A1P00488 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
F13A1P00488 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
F13A1P00488 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
F13A1P00488 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
F13A1P00488 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
F13A1P00488 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
F13A1P00488 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
F13A1P00488 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
F13A1P00488 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
F13A1P00488 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
F13A1P00488 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
F13A1P00488 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
F13A1P00488 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
F13A1P00488 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
F13A1P00488 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
F13A1P00488 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
F13A1P00488 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
F13A1P00488 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
F13A1P00488 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
F13A1P00488 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
F13A1P00488 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
F13A1P00488 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
F13A1P00488 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
F13A1P00488 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
F13A1P00488 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
F13A1P00488 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
F13A1P00488 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
F13A1P00488 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
F13A1P00488 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
F13A1P00488 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
F13A1P00488 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
F13A1P00488 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
F13A1P00488 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
F13A1P00488 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
F13A1P00488 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
F13A1P00488 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
F13A1P00488 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
F13A1P00488 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
F13A1P00488 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
F13A1P00488 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
F13A1P00488 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
F13A1P00488 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
F13A1P00488 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
F13A1P00488 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
F13A1P00488 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
F13A1P00488 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
F13A1P00488 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
F13A1P00488 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
F13A1P00488 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms