Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSPAN13O95857 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSPAN13O95857 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSPAN13O95857 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSPAN13O95857 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSPAN13O95857 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSPAN13O95857 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSPAN13O95857 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TSPAN13O95857 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSPAN13O95857 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSPAN13O95857 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSPAN13O95857 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSPAN13O95857 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSPAN13O95857 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSPAN13O95857 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSPAN13O95857 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSPAN13O95857 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSPAN13O95857 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSPAN13O95857 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSPAN13O95857 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSPAN13O95857 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSPAN13O95857 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSPAN13O95857 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TSPAN13O95857 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms