Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLSTN1O94985 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLSTN1O94985 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLSTN1O94985 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLSTN1O94985 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLSTN1O94985 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLSTN1O94985 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLSTN1O94985 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLSTN1O94985 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CLSTN1O94985 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLSTN1O94985 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLSTN1O94985 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLSTN1O94985 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLSTN1O94985 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLSTN1O94985 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLSTN1O94985 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLSTN1O94985 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLSTN1O94985 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLSTN1O94985 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLSTN1O94985 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLSTN1O94985 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLSTN1O94985 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLSTN1O94985 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLSTN1O94985 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLSTN1O94985 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CLSTN1O94985 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLSTN1O94985 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLSTN1O94985 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLSTN1O94985 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLSTN1O94985 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLSTN1O94985 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLSTN1O94985 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CLSTN1O94985 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLSTN1O94985 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CLSTN1O94985 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLSTN1O94985 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CLSTN1O94985 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLSTN1O94985 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CLSTN1O94985 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CLSTN1O94985 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLSTN1O94985 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLSTN1O94985 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLSTN1O94985 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CLSTN1O94985 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLSTN1O94985 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLSTN1O94985 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLSTN1O94985 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLSTN1O94985 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CLSTN1O94985 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CLSTN1O94985 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CLSTN1O94985 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CLSTN1O94985 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CLSTN1O94985 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLSTN1O94985 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLSTN1O94985 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CLSTN1O94985 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLSTN1O94985 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLSTN1O94985 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLSTN1O94985 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLSTN1O94985 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLSTN1O94985 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLSTN1O94985 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLSTN1O94985 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLSTN1O94985 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLSTN1O94985 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLSTN1O94985 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLSTN1O94985 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms