Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMCC1O94876 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMCC1O94876 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMCC1O94876 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMCC1O94876 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMCC1O94876 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMCC1O94876 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TMCC1O94876 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMCC1O94876 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMCC1O94876 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMCC1O94876 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMCC1O94876 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMCC1O94876 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMCC1O94876 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMCC1O94876 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMCC1O94876 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TMCC1O94876 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMCC1O94876 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMCC1O94876 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMCC1O94876 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMCC1O94876 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMCC1O94876 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMCC1O94876 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMCC1O94876 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMCC1O94876 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMCC1O94876 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMCC1O94876 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMCC1O94876 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TMCC1O94876 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMCC1O94876 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMCC1O94876 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMCC1O94876 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMCC1O94876 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMCC1O94876 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMCC1O94876 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMCC1O94876 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMCC1O94876 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMCC1O94876 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMCC1O94876 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMCC1O94876 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMCC1O94876 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TMCC1O94876 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMCC1O94876 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMCC1O94876 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMCC1O94876 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMCC1O94876 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMCC1O94876 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMCC1O94876 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMCC1O94876 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMCC1O94876 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMCC1O94876 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMCC1O94876 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMCC1O94876 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMCC1O94876 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMCC1O94876 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMCC1O94876 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMCC1O94876 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMCC1O94876 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMCC1O94876 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMCC1O94876 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMCC1O94876 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMCC1O94876 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMCC1O94876 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMCC1O94876 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMCC1O94876 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TMCC1O94876 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMCC1O94876 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TMCC1O94876 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMCC1O94876 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TMCC1O94876 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms