Protein–RNA interactions for Protein: O94856

NFASC, Neurofascin, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFASCO94856 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NFASCO94856 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NFASCO94856 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFASCO94856 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFASCO94856 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFASCO94856 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFASCO94856 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFASCO94856 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFASCO94856 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFASCO94856 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NFASCO94856 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFASCO94856 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFASCO94856 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFASCO94856 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFASCO94856 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFASCO94856 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFASCO94856 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NFASCO94856 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NFASCO94856 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NFASCO94856 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFASCO94856 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFASCO94856 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFASCO94856 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFASCO94856 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NFASCO94856 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFASCO94856 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFASCO94856 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFASCO94856 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFASCO94856 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFASCO94856 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFASCO94856 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFASCO94856 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFASCO94856 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFASCO94856 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFASCO94856 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFASCO94856 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFASCO94856 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFASCO94856 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFASCO94856 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFASCO94856 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFASCO94856 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFASCO94856 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFASCO94856 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFASCO94856 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFASCO94856 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFASCO94856 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFASCO94856 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFASCO94856 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFASCO94856 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NFASCO94856 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFASCO94856 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFASCO94856 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFASCO94856 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFASCO94856 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFASCO94856 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFASCO94856 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFASCO94856 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFASCO94856 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFASCO94856 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFASCO94856 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NFASCO94856 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NFASCO94856 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NFASCO94856 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NFASCO94856 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFASCO94856 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFASCO94856 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFASCO94856 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
NFASCO94856 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFASCO94856 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFASCO94856 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFASCO94856 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFASCO94856 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFASCO94856 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFASCO94856 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NFASCO94856 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFASCO94856 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFASCO94856 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NFASCO94856 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFASCO94856 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFASCO94856 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFASCO94856 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFASCO94856 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFASCO94856 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFASCO94856 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFASCO94856 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFASCO94856 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFASCO94856 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFASCO94856 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFASCO94856 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFASCO94856 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFASCO94856 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NFASCO94856 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NFASCO94856 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NFASCO94856 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NFASCO94856 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFASCO94856 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFASCO94856 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFASCO94856 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NFASCO94856 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFASCO94856 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1152.4 ms