Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DYSFO75923 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DYSFO75923 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DYSFO75923 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DYSFO75923 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DYSFO75923 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DYSFO75923 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DYSFO75923 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DYSFO75923 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DYSFO75923 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DYSFO75923 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DYSFO75923 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DYSFO75923 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DYSFO75923 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DYSFO75923 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DYSFO75923 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DYSFO75923 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DYSFO75923 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DYSFO75923 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DYSFO75923 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DYSFO75923 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DYSFO75923 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DYSFO75923 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DYSFO75923 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DYSFO75923 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DYSFO75923 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DYSFO75923 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DYSFO75923 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DYSFO75923 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DYSFO75923 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DYSFO75923 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DYSFO75923 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DYSFO75923 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DYSFO75923 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DYSFO75923 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DYSFO75923 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DYSFO75923 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DYSFO75923 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DYSFO75923 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DYSFO75923 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DYSFO75923 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DYSFO75923 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DYSFO75923 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DYSFO75923 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DYSFO75923 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DYSFO75923 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DYSFO75923 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DYSFO75923 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DYSFO75923 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DYSFO75923 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYSFO75923 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYSFO75923 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYSFO75923 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYSFO75923 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYSFO75923 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYSFO75923 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYSFO75923 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DYSFO75923 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DYSFO75923 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DYSFO75923 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DYSFO75923 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DYSFO75923 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DYSFO75923 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYSFO75923 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYSFO75923 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYSFO75923 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYSFO75923 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYSFO75923 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYSFO75923 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYSFO75923 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYSFO75923 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYSFO75923 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYSFO75923 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYSFO75923 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYSFO75923 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYSFO75923 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DYSFO75923 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYSFO75923 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYSFO75923 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DYSFO75923 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYSFO75923 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYSFO75923 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYSFO75923 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYSFO75923 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYSFO75923 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYSFO75923 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYSFO75923 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYSFO75923 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYSFO75923 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DYSFO75923 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
DYSFO75923 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DYSFO75923 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
DYSFO75923 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DYSFO75923 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DYSFO75923 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DYSFO75923 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DYSFO75923 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DYSFO75923 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DYSFO75923 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
DYSFO75923 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms