Protein–RNA interactions for Protein: O75818

RPP40, Ribonuclease P protein subunit p40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPP40O75818 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPP40O75818 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPP40O75818 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RPP40O75818 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPP40O75818 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPP40O75818 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPP40O75818 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPP40O75818 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RPP40O75818 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPP40O75818 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPP40O75818 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPP40O75818 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPP40O75818 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPP40O75818 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPP40O75818 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPP40O75818 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPP40O75818 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPP40O75818 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RPP40O75818 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPP40O75818 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPP40O75818 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPP40O75818 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RPP40O75818 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPP40O75818 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RPP40O75818 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RPP40O75818 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPP40O75818 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPP40O75818 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPP40O75818 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RPP40O75818 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPP40O75818 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPP40O75818 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPP40O75818 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPP40O75818 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPP40O75818 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPP40O75818 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPP40O75818 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPP40O75818 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPP40O75818 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPP40O75818 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPP40O75818 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RPP40O75818 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RPP40O75818 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPP40O75818 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPP40O75818 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPP40O75818 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPP40O75818 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPP40O75818 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPP40O75818 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPP40O75818 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPP40O75818 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPP40O75818 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPP40O75818 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPP40O75818 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPP40O75818 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPP40O75818 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPP40O75818 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPP40O75818 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPP40O75818 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPP40O75818 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPP40O75818 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPP40O75818 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPP40O75818 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPP40O75818 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPP40O75818 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPP40O75818 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RPP40O75818 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPP40O75818 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RPP40O75818 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RPP40O75818 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RPP40O75818 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RPP40O75818 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPP40O75818 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPP40O75818 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPP40O75818 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPP40O75818 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPP40O75818 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPP40O75818 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPP40O75818 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPP40O75818 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPP40O75818 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPP40O75818 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPP40O75818 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPP40O75818 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPP40O75818 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPP40O75818 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPP40O75818 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPP40O75818 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPP40O75818 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPP40O75818 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPP40O75818 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RPP40O75818 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPP40O75818 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPP40O75818 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPP40O75818 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPP40O75818 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPP40O75818 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPP40O75818 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPP40O75818 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPP40O75818 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms