Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
IGSF3O75054 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
IGSF3O75054 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
IGSF3O75054 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
IGSF3O75054 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
IGSF3O75054 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
IGSF3O75054 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
IGSF3O75054 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
IGSF3O75054 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
IGSF3O75054 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
IGSF3O75054 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
IGSF3O75054 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
IGSF3O75054 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
IGSF3O75054 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
IGSF3O75054 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
IGSF3O75054 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
IGSF3O75054 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
IGSF3O75054 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
IGSF3O75054 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
IGSF3O75054 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
IGSF3O75054 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
IGSF3O75054 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
IGSF3O75054 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
IGSF3O75054 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
IGSF3O75054 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
IGSF3O75054 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
IGSF3O75054 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
IGSF3O75054 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
IGSF3O75054 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
IGSF3O75054 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
IGSF3O75054 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
IGSF3O75054 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
IGSF3O75054 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
IGSF3O75054 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
IGSF3O75054 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
IGSF3O75054 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
IGSF3O75054 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
IGSF3O75054 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
IGSF3O75054 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
IGSF3O75054 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
IGSF3O75054 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
IGSF3O75054 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
IGSF3O75054 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
IGSF3O75054 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
IGSF3O75054 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
IGSF3O75054 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
IGSF3O75054 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
IGSF3O75054 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
IGSF3O75054 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
IGSF3O75054 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
IGSF3O75054 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
IGSF3O75054 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
IGSF3O75054 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
IGSF3O75054 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
IGSF3O75054 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
IGSF3O75054 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
IGSF3O75054 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
IGSF3O75054 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
IGSF3O75054 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
IGSF3O75054 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
IGSF3O75054 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
IGSF3O75054 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
IGSF3O75054 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
IGSF3O75054 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
IGSF3O75054 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
IGSF3O75054 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
IGSF3O75054 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
IGSF3O75054 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
IGSF3O75054 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
IGSF3O75054 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
IGSF3O75054 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
IGSF3O75054 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
IGSF3O75054 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
IGSF3O75054 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
IGSF3O75054 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
IGSF3O75054 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
IGSF3O75054 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
IGSF3O75054 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
IGSF3O75054 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
IGSF3O75054 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
IGSF3O75054 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
IGSF3O75054 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
IGSF3O75054 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
IGSF3O75054 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
IGSF3O75054 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
IGSF3O75054 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
IGSF3O75054 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
IGSF3O75054 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
IGSF3O75054 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
IGSF3O75054 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
IGSF3O75054 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
IGSF3O75054 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
IGSF3O75054 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
IGSF3O75054 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
IGSF3O75054 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
IGSF3O75054 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
IGSF3O75054 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
IGSF3O75054 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
IGSF3O75054 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
IGSF3O75054 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms