Protein–RNA interactions for Protein: O60925

PFDN1, Prefoldin subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN1O60925 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PFDN1O60925 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PFDN1O60925 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PFDN1O60925 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN1O60925 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN1O60925 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN1O60925 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN1O60925 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN1O60925 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN1O60925 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PFDN1O60925 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PFDN1O60925 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PFDN1O60925 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PFDN1O60925 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PFDN1O60925 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PFDN1O60925 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN1O60925 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN1O60925 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PFDN1O60925 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PFDN1O60925 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PFDN1O60925 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PFDN1O60925 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PFDN1O60925 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PFDN1O60925 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PFDN1O60925 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PFDN1O60925 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PFDN1O60925 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PFDN1O60925 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PFDN1O60925 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PFDN1O60925 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PFDN1O60925 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PFDN1O60925 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PFDN1O60925 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PFDN1O60925 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PFDN1O60925 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PFDN1O60925 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PFDN1O60925 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PFDN1O60925 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PFDN1O60925 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PFDN1O60925 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PFDN1O60925 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PFDN1O60925 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PFDN1O60925 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PFDN1O60925 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PFDN1O60925 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PFDN1O60925 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PFDN1O60925 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PFDN1O60925 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PFDN1O60925 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PFDN1O60925 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PFDN1O60925 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PFDN1O60925 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PFDN1O60925 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PFDN1O60925 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFDN1O60925 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFDN1O60925 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFDN1O60925 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFDN1O60925 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFDN1O60925 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFDN1O60925 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFDN1O60925 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFDN1O60925 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFDN1O60925 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFDN1O60925 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFDN1O60925 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN1O60925 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms