Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF2O60811 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF2O60811 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF2O60811 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF2O60811 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF2O60811 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF2O60811 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF2O60811 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF2O60811 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF2O60811 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF2O60811 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF2O60811 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF2O60811 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF2O60811 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF2O60811 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF2O60811 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF2O60811 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF2O60811 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF2O60811 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF2O60811 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF2O60811 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF2O60811 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF2O60811 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF2O60811 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF2O60811 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF2O60811 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF2O60811 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF2O60811 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF2O60811 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF2O60811 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF2O60811 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF2O60811 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF2O60811 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF2O60811 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF2O60811 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF2O60811 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF2O60811 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF2O60811 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF2O60811 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF2O60811 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF2O60811 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF2O60811 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF2O60811 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.1 ms