Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BNIP3LO60238 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BNIP3LO60238 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BNIP3LO60238 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BNIP3LO60238 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BNIP3LO60238 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BNIP3LO60238 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BNIP3LO60238 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BNIP3LO60238 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BNIP3LO60238 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BNIP3LO60238 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BNIP3LO60238 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BNIP3LO60238 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BNIP3LO60238 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BNIP3LO60238 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BNIP3LO60238 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BNIP3LO60238 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BNIP3LO60238 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BNIP3LO60238 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BNIP3LO60238 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms