Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CREB3O43889 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CREB3O43889 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CREB3O43889 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CREB3O43889 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CREB3O43889 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CREB3O43889 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CREB3O43889 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CREB3O43889 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CREB3O43889 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CREB3O43889 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CREB3O43889 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CREB3O43889 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CREB3O43889 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREB3O43889 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREB3O43889 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREB3O43889 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREB3O43889 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREB3O43889 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CREB3O43889 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CREB3O43889 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CREB3O43889 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CREB3O43889 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CREB3O43889 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CREB3O43889 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CREB3O43889 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CREB3O43889 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CREB3O43889 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CREB3O43889 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CREB3O43889 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CREB3O43889 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CREB3O43889 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CREB3O43889 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CREB3O43889 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CREB3O43889 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CREB3O43889 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CREB3O43889 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CREB3O43889 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CREB3O43889 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CREB3O43889 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CREB3O43889 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CREB3O43889 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CREB3O43889 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CREB3O43889 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CREB3O43889 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CREB3O43889 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CREB3O43889 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CREB3O43889 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CREB3O43889 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CREB3O43889 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CREB3O43889 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CREB3O43889 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CREB3O43889 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CREB3O43889 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CREB3O43889 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CREB3O43889 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CREB3O43889 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CREB3O43889 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CREB3O43889 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CREB3O43889 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CREB3O43889 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CREB3O43889 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CREB3O43889 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CREB3O43889 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CREB3O43889 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CREB3O43889 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CREB3O43889 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CREB3O43889 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CREB3O43889 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CREB3O43889 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CREB3O43889 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREB3O43889 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREB3O43889 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CREB3O43889 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREB3O43889 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREB3O43889 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREB3O43889 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREB3O43889 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREB3O43889 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREB3O43889 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREB3O43889 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREB3O43889 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREB3O43889 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CREB3O43889 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CREB3O43889 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CREB3O43889 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CREB3O43889 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CREB3O43889 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CREB3O43889 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CREB3O43889 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CREB3O43889 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CREB3O43889 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CREB3O43889 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CREB3O43889 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CREB3O43889 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CREB3O43889 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CREB3O43889 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CREB3O43889 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CREB3O43889 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CREB3O43889 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.8 ms