Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP9O43818 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP9O43818 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP9O43818 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP9O43818 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP9O43818 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP9O43818 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP9O43818 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP9O43818 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP9O43818 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP9O43818 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP9O43818 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RRP9O43818 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RRP9O43818 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP9O43818 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP9O43818 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP9O43818 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP9O43818 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP9O43818 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP9O43818 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP9O43818 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP9O43818 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP9O43818 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP9O43818 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP9O43818 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP9O43818 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP9O43818 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP9O43818 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP9O43818 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP9O43818 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP9O43818 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP9O43818 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP9O43818 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP9O43818 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP9O43818 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP9O43818 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP9O43818 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP9O43818 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP9O43818 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP9O43818 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP9O43818 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP9O43818 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP9O43818 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP9O43818 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP9O43818 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRP9O43818 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRP9O43818 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP9O43818 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP9O43818 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP9O43818 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP9O43818 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP9O43818 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP9O43818 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP9O43818 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP9O43818 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP9O43818 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP9O43818 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP9O43818 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP9O43818 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP9O43818 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP9O43818 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP9O43818 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP9O43818 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP9O43818 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP9O43818 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP9O43818 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP9O43818 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP9O43818 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP9O43818 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP9O43818 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP9O43818 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP9O43818 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP9O43818 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP9O43818 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP9O43818 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP9O43818 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP9O43818 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP9O43818 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP9O43818 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP9O43818 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP9O43818 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RRP9O43818 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RRP9O43818 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP9O43818 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP9O43818 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP9O43818 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP9O43818 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP9O43818 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP9O43818 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP9O43818 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP9O43818 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP9O43818 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP9O43818 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP9O43818 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP9O43818 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP9O43818 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP9O43818 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP9O43818 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP9O43818 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP9O43818 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms