Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNGR3O43761 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGR3O43761 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGR3O43761 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGR3O43761 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGR3O43761 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGR3O43761 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGR3O43761 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGR3O43761 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGR3O43761 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGR3O43761 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGR3O43761 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGR3O43761 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGR3O43761 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGR3O43761 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGR3O43761 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGR3O43761 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYNGR3O43761 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNGR3O43761 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNGR3O43761 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms