Protein–RNA interactions for Protein: O43613

HCRTR1, Orexin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCRTR1O43613 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCRTR1O43613 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HCRTR1O43613 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HCRTR1O43613 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCRTR1O43613 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCRTR1O43613 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCRTR1O43613 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCRTR1O43613 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCRTR1O43613 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCRTR1O43613 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCRTR1O43613 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HCRTR1O43613 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HCRTR1O43613 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCRTR1O43613 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCRTR1O43613 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCRTR1O43613 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCRTR1O43613 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCRTR1O43613 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCRTR1O43613 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCRTR1O43613 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCRTR1O43613 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCRTR1O43613 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCRTR1O43613 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCRTR1O43613 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCRTR1O43613 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCRTR1O43613 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCRTR1O43613 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCRTR1O43613 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCRTR1O43613 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCRTR1O43613 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCRTR1O43613 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCRTR1O43613 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCRTR1O43613 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCRTR1O43613 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCRTR1O43613 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCRTR1O43613 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HCRTR1O43613 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCRTR1O43613 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCRTR1O43613 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCRTR1O43613 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCRTR1O43613 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCRTR1O43613 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCRTR1O43613 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HCRTR1O43613 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCRTR1O43613 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCRTR1O43613 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCRTR1O43613 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCRTR1O43613 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCRTR1O43613 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCRTR1O43613 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCRTR1O43613 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCRTR1O43613 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCRTR1O43613 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCRTR1O43613 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HCRTR1O43613 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCRTR1O43613 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HCRTR1O43613 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCRTR1O43613 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCRTR1O43613 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCRTR1O43613 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCRTR1O43613 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCRTR1O43613 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCRTR1O43613 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCRTR1O43613 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCRTR1O43613 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCRTR1O43613 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCRTR1O43613 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCRTR1O43613 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HCRTR1O43613 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HCRTR1O43613 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCRTR1O43613 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCRTR1O43613 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms