Protein–RNA interactions for Protein: O43299

AP5Z1, AP-5 complex subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5Z1O43299 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
AP5Z1O43299 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AP5Z1O43299 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AP5Z1O43299 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AP5Z1O43299 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AP5Z1O43299 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AP5Z1O43299 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AP5Z1O43299 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
AP5Z1O43299 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AP5Z1O43299 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AP5Z1O43299 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AP5Z1O43299 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
AP5Z1O43299 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
AP5Z1O43299 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
AP5Z1O43299 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AP5Z1O43299 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AP5Z1O43299 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AP5Z1O43299 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
AP5Z1O43299 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AP5Z1O43299 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AP5Z1O43299 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
AP5Z1O43299 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AP5Z1O43299 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AP5Z1O43299 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AP5Z1O43299 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
AP5Z1O43299 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AP5Z1O43299 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AP5Z1O43299 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AP5Z1O43299 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AP5Z1O43299 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AP5Z1O43299 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AP5Z1O43299 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AP5Z1O43299 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AP5Z1O43299 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AP5Z1O43299 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AP5Z1O43299 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AP5Z1O43299 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AP5Z1O43299 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AP5Z1O43299 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AP5Z1O43299 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AP5Z1O43299 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AP5Z1O43299 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AP5Z1O43299 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AP5Z1O43299 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AP5Z1O43299 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AP5Z1O43299 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AP5Z1O43299 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AP5Z1O43299 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AP5Z1O43299 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AP5Z1O43299 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AP5Z1O43299 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AP5Z1O43299 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AP5Z1O43299 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
AP5Z1O43299 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AP5Z1O43299 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AP5Z1O43299 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AP5Z1O43299 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AP5Z1O43299 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
AP5Z1O43299 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AP5Z1O43299 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AP5Z1O43299 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AP5Z1O43299 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AP5Z1O43299 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AP5Z1O43299 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AP5Z1O43299 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
AP5Z1O43299 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AP5Z1O43299 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AP5Z1O43299 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AP5Z1O43299 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AP5Z1O43299 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AP5Z1O43299 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AP5Z1O43299 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AP5Z1O43299 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AP5Z1O43299 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AP5Z1O43299 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AP5Z1O43299 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AP5Z1O43299 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AP5Z1O43299 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
AP5Z1O43299 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AP5Z1O43299 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AP5Z1O43299 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AP5Z1O43299 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AP5Z1O43299 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AP5Z1O43299 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AP5Z1O43299 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AP5Z1O43299 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AP5Z1O43299 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
AP5Z1O43299 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
AP5Z1O43299 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
AP5Z1O43299 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
AP5Z1O43299 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AP5Z1O43299 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AP5Z1O43299 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AP5Z1O43299 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
AP5Z1O43299 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AP5Z1O43299 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AP5Z1O43299 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AP5Z1O43299 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AP5Z1O43299 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AP5Z1O43299 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms