Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
MSH5O43196 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
MSH5O43196 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
MSH5O43196 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
MSH5O43196 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
MSH5O43196 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
MSH5O43196 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
MSH5O43196 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
MSH5O43196 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
MSH5O43196 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
MSH5O43196 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
MSH5O43196 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
MSH5O43196 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
MSH5O43196 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
MSH5O43196 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
MSH5O43196 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
MSH5O43196 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
MSH5O43196 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
MSH5O43196 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
MSH5O43196 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
MSH5O43196 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
MSH5O43196 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
MSH5O43196 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
MSH5O43196 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
MSH5O43196 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
MSH5O43196 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
MSH5O43196 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
MSH5O43196 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
MSH5O43196 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
MSH5O43196 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
MSH5O43196 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
MSH5O43196 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
MSH5O43196 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
MSH5O43196 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
MSH5O43196 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
MSH5O43196 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
MSH5O43196 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
MSH5O43196 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
MSH5O43196 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
MSH5O43196 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
MSH5O43196 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
MSH5O43196 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
MSH5O43196 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
MSH5O43196 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
MSH5O43196 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
MSH5O43196 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
MSH5O43196 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
MSH5O43196 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
MSH5O43196 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
MSH5O43196 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
MSH5O43196 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
MSH5O43196 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
MSH5O43196 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
MSH5O43196 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
MSH5O43196 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
MSH5O43196 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
MSH5O43196 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MSH5O43196 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MSH5O43196 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MSH5O43196 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
MSH5O43196 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MSH5O43196 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MSH5O43196 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
MSH5O43196 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MSH5O43196 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MSH5O43196 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
MSH5O43196 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
MSH5O43196 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
MSH5O43196 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
MSH5O43196 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
MSH5O43196 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
MSH5O43196 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
MSH5O43196 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
MSH5O43196 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
MSH5O43196 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
MSH5O43196 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
MSH5O43196 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
MSH5O43196 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
MSH5O43196 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
MSH5O43196 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
MSH5O43196 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
MSH5O43196 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
MSH5O43196 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
MSH5O43196 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
MSH5O43196 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
MSH5O43196 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
MSH5O43196 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
MSH5O43196 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
MSH5O43196 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
MSH5O43196 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
MSH5O43196 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
MSH5O43196 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
MSH5O43196 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
MSH5O43196 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
MSH5O43196 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
MSH5O43196 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
MSH5O43196 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
MSH5O43196 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
MSH5O43196 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
MSH5O43196 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms