Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
FANCAO15360 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
FANCAO15360 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
FANCAO15360 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
FANCAO15360 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
FANCAO15360 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
FANCAO15360 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
FANCAO15360 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
FANCAO15360 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
FANCAO15360 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
FANCAO15360 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
FANCAO15360 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
FANCAO15360 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
FANCAO15360 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
FANCAO15360 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC39.4■■■■□ 3.9
FANCAO15360 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
FANCAO15360 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
FANCAO15360 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
FANCAO15360 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
FANCAO15360 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
FANCAO15360 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
FANCAO15360 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
FANCAO15360 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
FANCAO15360 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
FANCAO15360 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
FANCAO15360 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
FANCAO15360 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
FANCAO15360 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
FANCAO15360 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
FANCAO15360 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
FANCAO15360 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
FANCAO15360 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
FANCAO15360 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
FANCAO15360 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
FANCAO15360 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
FANCAO15360 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
FANCAO15360 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
FANCAO15360 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
FANCAO15360 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
FANCAO15360 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
FANCAO15360 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
FANCAO15360 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC39.3■■■■□ 3.88
FANCAO15360 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
FANCAO15360 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
FANCAO15360 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
FANCAO15360 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
FANCAO15360 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
FANCAO15360 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
FANCAO15360 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
FANCAO15360 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
FANCAO15360 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
FANCAO15360 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
FANCAO15360 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC39.24■■■■□ 3.87
FANCAO15360 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
FANCAO15360 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
FANCAO15360 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
FANCAO15360 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
FANCAO15360 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
FANCAO15360 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
FANCAO15360 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
FANCAO15360 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
FANCAO15360 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
FANCAO15360 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
FANCAO15360 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
FANCAO15360 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
FANCAO15360 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
FANCAO15360 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
FANCAO15360 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.18■■■■□ 3.86
FANCAO15360 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
FANCAO15360 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
FANCAO15360 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
FANCAO15360 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
FANCAO15360 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
FANCAO15360 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
FANCAO15360 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC39.15■■■■□ 3.86
FANCAO15360 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
FANCAO15360 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
FANCAO15360 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
FANCAO15360 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
FANCAO15360 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
FANCAO15360 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
FANCAO15360 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
FANCAO15360 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
FANCAO15360 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
FANCAO15360 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
FANCAO15360 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
FANCAO15360 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
FANCAO15360 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
FANCAO15360 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
FANCAO15360 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
FANCAO15360 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
FANCAO15360 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
FANCAO15360 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
FANCAO15360 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
FANCAO15360 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC39.06■■■■□ 3.84
FANCAO15360 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
FANCAO15360 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
FANCAO15360 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
FANCAO15360 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
FANCAO15360 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms