Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMA5O15230 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMA5O15230 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA5O15230 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA5O15230 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA5O15230 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA5O15230 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA5O15230 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA5O15230 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA5O15230 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA5O15230 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA5O15230 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA5O15230 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA5O15230 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA5O15230 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA5O15230 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA5O15230 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA5O15230 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA5O15230 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA5O15230 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA5O15230 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA5O15230 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA5O15230 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA5O15230 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA5O15230 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms